Introduction
Cette page concerne l'UE 3 - Scientométrie, Bibliométrie : Mesures et représentations de la production scientifique du Master 2 IMST (Information et médiation scientifique et technique), parcours EISO (Epistémologie et Ingénierie de la Science Ouverte).
Plus particulièrement, elle sert de support à la partie dont je (Rémy Cazabet) suis responsable, portant sur l'analyse en réseau des données scientifiques, ainsi qu'à l'outil d'analyse de réseaux Gephi.

Objectifs
L'objectif de ce cours est d'acquérir les compétences suivantes:

1. Savoir comment une base de données bibliographique en accès libre, telle HAL, peut être interrogée en utilisant un language de programmation
2. Savoir passer de données brutes à des données modélisées sous la forme d'un graphe, et les bonnes questions à se poser
3. Connaître les bases du domaine de la science des réseaux (Network Science), permettant de décrire et d'analyser des données représentées sous forme de graphes
4. Savoir utiliser le logiciel libre Gephi pour 1)Calculer des indicateurs d'analyse de réseaux et 2)Produire des visualisations sous forme de réseaux de données de co-citations ou de collaborations.

Présentations Générale du cours
Le cours sera composé de 4 séances, soit 10h de cours. La dernière séance sera dévolue au projet.
Le cours sera évalué par un projet à effectuer en groupe (voir section correspondante).

Ci-dessous le programme prévisionnel des cours. Les cours auront lieu de 14h à 16h30 le Mercredi.
Ce programme est encore provisoire!.

Créneau	Sujet	Ressources
Mercredi 22/09	Introduction, Description de réseaux, Gephi 1	PDF-Réseaux-Descriptions PDF-Gephi Exercices Gephi: Introduction Formulaire science des réseaux
Mercredi 6/10	Réseaux: centralité, Gephi 2	PDF-Réseaux-Centralités Exercices Gephi: Centralité, Communautés Exercices Gephi: Créer son propre réseau
Mercredi 20/10	Collection de données depuis HAL, Gephi 3	Présentation de HAL Requetes API HAL Exemple pour démarrer Pour aller plus loin: Introduction aux structures de données python Introduction à Pandas
Mercredi 3/11	Travail sur le projet

Pour ce cours, vous allez avoir besoin de deux choses: Le logiciel Gephi et une installation de Python avec quelques librairies installées (Mais pour python, en cas de problème, vous pourrez travailler sur un outil en ligne)

Gephi

Gephi est l'outil le plus pratique pour visualiser des réseaux, et faire des analyses simples sans programmation.
Il peut être téléchargé ici : Gephi.
Gephi requiert Java, et à quelques bugs sous Windows, en particulier lors de l'installation. Je vous recommande donc d'essayer de l'installer à l'avance. Vous pouvez trouver ici la solution à 2 problèmes qui arrivent parfois:

• Cannot find java (remplacer gephi.conf au lieu de netbeans.conf
• Exception on range slider

Python

Pour la partie requête de bases de données bibliométriques, nous utiliserons python. Il est possible de travailler en ligne avec un outil tel que Google colab, mais il est beaucoup plus pratique d'avoir votre propre installation. Le plus simple est d'utiliser la distribuiton Anaconda, qui viens déjà avec la plupart des librairies nécessaires installées. Les librairies que nous utiliserons sont:

• networkx. Analyse de réseaux
• notebook. Jupyter notebook
• requests. Requetes sur des API
• pandas. Manipulation de données
• seaborn. création de graphiques